‹header›
‹date/time›
Klicken Sie, um die Textformatierung des Masters zu
bearbeiten.
Zweite Ebene
Dritte Ebene
Vierte Ebene
Fünfte Ebene
‹footer›
‹#›
På min institution
studerar vi hur celler regleras. Hur vet tex en tarmcell att den skall se ut som den gör.
Jag skall idag
försöka introducera det system som jag använder för att studera dessa frågor nämligen en liten mask som Caenorhabditis elegans.
IDenna organism blev igår världsberömd eftersom Nobelpriset i fysiologi tilldeleades 3 maskforskare. Sydney
som kallas masken far bestämde att detta var en utmärkt organism att använda, Horwits och
Sulston har bidragit genom kartläggning av den och jag kommer tillbaka till mer exakt vad dom gjort
lite senare.
Den centrala dogmen i
molekylär biologi brukar detta kallas. I alla organismer finns
DNA, hos mask och människa i den sk cell kärnan. Här finns information lagrad för att bygga upp hela den organism som DNA:t kommer ifrån.
Detta skrivs av och blir till en mRNA molekyl som är en
direkt avskrift av DNA och detta RNA transporterars sedan
till en annan del av cellen där den fungerar som mall för
ihop byggnaden av proteiner.
Det viktiga att komma
ihåg är att om man förändrar DNA så påverkar det hur proteinet
kommer att se ut och om man har otur kan proteinet inte fungera.
Så här der masken ut som vi tittar på den i laboratoriet i ett
stereomikroskåp. Den är
genomskinlig.
Det finns hermafroditer
och hanar. Hermafroditerna är honor som producerar egna
spermier. Hermafroditer bär det befruktade ägget inne i gonaden till det består av ca 100 celler och då lägger hon ägg genom en öppning som
kallas vulva.
Presentera egenskaper som gör den användbar. Den har en kort
livscykel eller generations tid. Det är bra när man vill
studera genetiska effekter. Det kommer jag förklara lite
mer längre fram. Man odlar masken på agar plattor i rumstemperatur.
(Visa platta) . Man kan också frysa ner dom och sedan tina upp dom och tillräckligt många kommer att överleva. Mycket användbart då
man kan förvara stammar som har en specifik förändring i
decennier.
Hermafroditen lägger ett ägg som kläcks och sedan finns det 4
stycken larvstadier innan masken blir vuxen och kan lägga
egna ägg.
Om det finns lite mat kan masken gå in i
ett sk sporstadie som kallas dauer och leva flera månader
annars. Annars åldras och dör dom inom 3 veckor.
Detta är en liten film hur masken ser ut när den kryper omkring
Den färdiga masken består
av 959 celler. Man har genom årets Nobelpristagare fått
fram hela cellinje. DVs man vet vad varje cell från cell 1 till 959 gör. Detta
gjordes genom att stirra i mikroskåp.
Här kan man se vad man har kallat cellerna och ungefär
hur det ungefär ser ut i mikroskåpet. P0 är precis efter
spermien har befruktat och sedan börjar celldelningen.
Ett cellinje träd finns för alla don 1090 celler som bildas och här har
jag hur MS cellen går
vidare och delar sig och bildar bla muskler (bm) Men av dessa 1090 genogår 131 programmerad celldöd (x i
trädet) och kvar blir 959 celler som bygger upp masken.
Hela genomet,DNA
sekvensendvs vilken ordning baserna A,C,G och T kommer i
är känd sedan 1998 och var det första djuret som blev sekvensat. Här bidrog framförallt John Sulston en av pristagarna. Som vi ser är det humana
genomet mycket större men när man tittar på hur många
gener det finns slås man av hur lika vi är människa har
bara 3.5 gånger fler gener ungefär. Det humana genomet innehåller
ocksa mycket sk skräp DNA som man idag inte vet vad eller om det har någon funktion.
SPower of genetics, jag måste först förklara vad en
mutation är
Spontana det är sådana som sker utan att någon påverkar. Tex vid
celldelning eller av
normal UV-strålning från solen. Inducerade är sådana som man får fram genom att utsätta en organism för
kemikaler, UV eller andra typper av strålning. Detta sker slumpmässigt.
Specig är när man slår ut en gen
specigkt kallas för Knock-out eller gene tageting.
Så när man väl har sekvensen är man färdig då?
Nej fäör man vet ju fortfarande inte vad dom flesta proteinerna har för funktion. Därför använder man
genetiska metoder för att
ta reda på det. LÄS!
Tänkte kort gå igenom vad
en gentisk screen är. LÄS!
På så sätt kan man koppla DNA
till en specifik funktion och få reda på vad genen har för funktion.
I c.elegans finns massor med mutanter identifierad. Av tradition beskriver
dom fenotypen på den
muterade masken och förkortas till 3 bokstäver och 1 siffra.
Tänkte bara visa hur några mutanter ser ut. Dumpy är engelska och betyder
kort och tjock.
Rollers mutanter kan inte gå i sinusvåg utan gör runda märken i plattan
efter som den snurrar
runt.
Unc står för uncordinated och dessa har problem att ta sig fram.
Jag tänkte ge ett litet exempel på hur man kan använda masken för att
studera saker som
påverkar oss. Alzheimer är ju inget man direkt tänker sig att man kan studera i en mask, dessa får ju
knappast denna sjukdom. Men man har identifierat en gen som ofta är muterad i ärftlig Alzheimer, presinilin-1.
Det finns en homolog,
liknande, gen i C.elegan sel-1. sel-1 mutanter får en fenotyp som kallas multivulva. Dvs den bildar
flera stycken vulvor. Hur går det till?
I människa leder presilin mutationer till att det bildas mer av en typ av
peptider som bilda långa
fibrer och skapa sk plack. Hos c.elegans leder mutationer i sel12 till att en viss celltyp
aktiveras vulva gener i celler som
egentligen inte skall bli
vulva och därför får man flera vulvor.
För att identifiera fler proteiner involverade och för att förstå mer om signalkedjan kan man lätt göra
genetiska screener eftersom fenotypen är lätt identifierad.
Man kan ju också testa hur potentiella droger påverkar denna
signalväg i maksen.
Ett projekt som vi precis startat och hoppas kunna hitta intressanta
saker.
Vio tittar på en gen familj som heter forkhead. Detta är proteiner som
påverkar andra proteiner genom att slå av och på dom.
I c.elegans finns
flera stammar som har ett protein märkt med GFP och detta uttrycks sedan i specifika celler. Vi
slår ut vår gen med rreverse genetics och ser vad som händer. Det vi framförallt identifierat
är att i många fall har cellerna svårt att hitta sin plats i masken och att dom inte kan differentiera
eller mogna på rätt sätt.